中國-東盟中心第一屆執行委員會會議和第一屆聯合理事會會議分別于2012年5月17日和18日在中國-東盟中心總部召開，來自中心11個成員國的34位代表出席了會議。

執行委員會會議由中國外交部亞洲司副司長楊健與柬埔寨駐中國大使西索達共同主持。會議集中討論了秘書處提交的系列文件，提出了修改意見，并形成了書面報告。聯合理事會會議由中國常駐東盟大使佟曉玲與柬埔寨常駐東盟代表坎帕里先后主持，審議通過了聯合執行委員會提交的中國-東盟中心聯合理事會章程、秘書長職責范圍、秘書長任命、標識、秘書處組織結構、工作人員條例、財務條例、2012年工作規劃和2012-2017五年工作規劃、2012年經費預算、聯系會員細則等文件，決定下屆聯合理事會會議于2012年第四季度在北京召開。

聯合理事會任命馬明強先生為中心首任秘書長。

中國東盟中心首屆聯合理事會順利召開和圓滿結束，標志著中心自去年11月18日成立以來完成了建章立制的工作。會議通過的系列文件為中心的健康發展提供了制度保障和法理依據，對中心在大力推動并實現中國與東盟國家間在貿易、投資、旅游、文化和教育等方面的務實合作具有十分重要的意義。